Добрый день!

Раньше было все проще, один домен почтовый и один адрес входящей/исходящей почты.

Теперь у меня ситуация следующая: почтовый сервер имеет адрес и на pop и на smtp.
Что в таком случае указывать в Email notification? Если указываешь адрес, либо pop, либо smtp, ни чего не куда не приходит....

Скорее всего, smtp, т.к. ОХО отправляет почту. Но на вашем сервере должен быть разрешен forward сообщений. Обычно, это запрещают.